お世話様です。回答ありがとうございます。
suphpを有効にしてsafe_modeはoffにしてあります。
ただpleskを利用しておりますので、個別に設定していない
サイトではphpはwebサーバーのユーザーで実行されています。
suphp利用設定　safe_mode_off 設定したユーザー
suphp未設定　safe_mode_on　apache
となっています。

今回の問題は複数ユーザーで利用しようとした為でした。

自分の管理しているxoopsサイトが委託を含めて4つほどあるためまとめて管理しようとしておりました。
Pleskではドメインごとに管理ユーザーを作成し実行するので、suphpを設定するとそれぞれのユーザーが、しない場合apacheでのアクセスが発生します。
ですので、現在はapache.共通のグループという形で回避していました。

実はまだテストサイトでの実験中で複数ドメイン下でのテストにはうつっていないのですが、複数実行ユーザーで運用した場合には問題が発生しますでしょうか？

検証はする予定ですが、教えて頂けると助かります（汗