これは、ニュースモジュールで使用しているテーブルではないかと思うのですが、調べたところ、どうやらMySQL 4.1系ではDb charactersetが binary だと(インストールできないなど)エラーになるモジュールがいくつかあるようです。(newsやnewbbなど)
newbbは使用していないし、 newsもたいして使っていなかったので捨ててもよいのですが、恥ずかしながら勉強不足の為、エラーの原因がわからないので、Db charactersetがbinaryのまま使っていても他のモジュールには影響がないのかどうか判断が出来ません。