enhiro さん、こんにちは。
これは不具合じゃないですね。
ブラウザまたはプロキシのキャッシュの関係でしょう。
zipとtar.gzは同時に生成して、rsyncで上げるので、どちらか一方だけが古かった、なんてことは過去に一度もありませんでした。
(rsync自体をかけ忘れていた、というミスなら数えきれませんが
)
ただ、同じ報告は何度ももらってます。
おそらくは、mydownloadsのリダイレクト方法が一部のキャッシュシステムと相性問題を引き起こしているんじゃないかな、と想像してます。
http://www.peak.ne.jp/support/xoops/から落としてもらえばより確実なはずです。