この現象は、 Windows環境で作成したDBのデータをUNIX環境に持って行った場合に限定されます。
ただ、WARPなどの環境でデータを作成してから、UNIX環境にデータを移行して運用なんてケースも考えられるので、その場合は上記パッチを適用して頂いた方が良いと思われます。
SELECT (snip) WHERE dirname='PICO'
ALTER TABLE (prefix)_modules MODIFY `dirname` varchar(25) binary NOT NULL default '';
$constpref = '_MI_' . strtoupper( $mydirname ) ;