GIJOEさんこんにちは。

コンテンツをすべてTOPカテゴリーに新規作成した場合、
ホームページ側のメインメニューのサブメニューが
「コンテンツ一括管理」の表示順にマッチしないので、以下のように XOOPS_TRUST側の xoops_version.php（47行目辺り）のSQL文に

"SELECT content_id,vpath,subject FROM ".$db->prefix($mydirname."_contents" )." o WHERE cat_id=0 AND show_in_menu AND visible AND $whr_read4content ORDER BY weight"　

と赤字の部分を追加してみたのですがOKでしょうか？

p.s
0.97ダウンロードしてもmodversion['version'] が0.96のままでした。

xampp1.5.5 win local
apache 2.2.3
php 5.2.0
mysql 5.0.27